La República Argentina y la Soberana Orden de Malta establecieron relaciones diplomáticas en 1948. En 1979 se firmó un Acuerdo Postal.
En 1960, la Soberana Orden de Malta recibió la visita oficial del Presidente de la República Argentina, Arturo Ercole Frondizi. El Presidente Frondizi fue recibido por Fra’ Ernesto Paternò Castelli di Carcaci, quien en ese momento ocupaba el cargo de Lugarteniente del Gran Maestre.
En 1990, el Gran Maestre de la Soberana Orden de Malta, el hoy Venerable Fra’ Andrew Bertie, viajó a la República Argentina en visita oficial y fue recibido por el Presidente de la Nación, Dr. Carlos Saúl Menem, como parte de una extensa gira por América Latina, que también incluyó Chile, Paraguay, Uruguay y Brasil.
En 2003, Fra’ Andrew Bertie recibió la visita oficial del Presidente de la República Argentina, Eduardo Duhalde. El presidente estuvo acompañado por su esposa, el Secretario de Cultura Embajador Esteban Caselli, y el Embajador argentino ante la Orden, Vicente Espeche Gil. El encuentro tuvo lugar en el Gran Magisterio, en Roma.
En 2004, el Ministro de Relaciones Exteriores de la República Argentina visitó la Soberana Orden de Malta, fortaleciendo aún más las relaciones bilaterales entre ambas partes.
El 1 de julio de 2021, Felipe Carlos Solá, Ministro de Relaciones Exteriores de la República Argentina, fue recibido por el Gran Canciller, Albrecht Boeselager. En la reunión estuvieron presentes la Embajadora argentina ante la Soberana Orden de Malta, María Fernanda Silva, y el Secretario General de Asuntos Exteriores de la Orden, Stefano Ronca.
Al año siguiente, el Secretario de Culto de la República Argentina, Embajador Guillermo Rodolfo Oliveri, fue recibido en el Palacio Magistral por el Embajador Stefano Ronca. La guerra en Ucrania, sus consecuencias económicas incluso al otro lado del Atlántico y en Sudamérica, así como la importancia del diálogo interreligioso, fueron algunos de los temas abordados durante el encuentro
